La col·lecció del fons del Museu de l’Educació es nodreix del patrimoni històric-educatiu de les Illes Balears. Com podem veure a les taules següents, el fons és quasi en la seva totalitat de l’illa de Mallorca -concretament un 94,59%- i la majoria de peces que s’han incorporat són de centres d’educació infantil i de primària.

.

Proporcionalment s’observa que, per a la majoria de les institucions susceptibles de ser posseïdores de patrimoni històric-educatiu, el percentatge d'aportacions que han fet al Museu no arriba a un 28,76% com a màxim.

Les institucions que han fet aportacions al Museu són:

Escoles d’educació infantil

EI Paula Torres.

Centres d’educació infantil i primària

CEIP Alexandre Rosselló, Palma. CEIP Antònia Alzina, Lloret. CEIP Ariany. CEIP Blai Bonet, Santanyí. CEIP Can Bril, Sancelles. CEIP Can Pastilla, Palma. CEIP Castell de Santa Àgueda, Ferreries. CEIP Costa i Llobera, Pollença. CEIP Duran Estrany, Llubí. CEIP Elionor Bosch, Santa Margalida CEIP Els Molins, Búger. CEIP Es Molinar, Infant Felip,  Palma. CEIP Es Puig, Lloseta. CEIP Es Puig, Sóller. CEIP Es Torrentet, Biniamar. CEIP Es Vinyet, Andratx. CEIP Es Vivero, Palma. CEIP Establiments, Palma. CEIP Felip Bauçà, Palma. CEIP Gabriel Comas i Ribes, Esporles. CEIP Guillem Ballester i Cerdó, Muro. CEIP Guillem Cifre de Colonya, Pollença. CEIP Inspector Joan Capó, Felanitx. CEIP Jafudà Cresques, Palma. CEIP Jaume I, Palma. CEIP Joan Mas, Pollença. CEIP Joan Veny i Clar, Campos. CEIP La Soledat, Palma. CEIP Llevant, Inca.  CEIP Maria de la Salut, 3. CEIP Marian Aguiló, Palma. CEIP Melcior Rosselló i Simonet, Santa Maria. CEIP Mestre Guillem Galmés, Sant Vicenç des Cardassar. CEIP Migjorn, Cas Concos, Felanitx. CEIP Miquel Porcel, Palma. CEIP Nicolau Calafat, Valldemossa. CEIP Nostra Senyora de Robines, Binissalem. CEIP Pintor Joan Miró, Palma. CEIP Ponent, Inca. CEIP Porta des Moll, Alcúdia. CEIP Pràctiques, Palma. CEIP Puig de Sa Morisca, Calvià. CEIP Rafal Nou, Palma. CEIP Rei Jaume III, Llucmajor. CEIP Reina Sofia, S’Horta, Felanitx. CEIP Sa Graduada, Sa Pobla. CEIP Sa Indioteria, Palma. CEIP Sa Quintana, Sineu. CEIP Secar de la Real, Palma. CEIP Ses Marjades, Sóller. CEIP Ses Roques, Caimari. CEIP Ses Salines. CEIP S’Algar, Portocolom, Felanitx. CEIP S’Alzinar, Capdepera. CEIP Santa Isabel, Palma. CEIP Ses Rotes Velles, Calvià. CEIP Simó Ballester, Manacor. CEIP Sant Bartomeu, Alaró. CEIP Son Anglada, Palma. CEIP Son Serra, Palma. CEIP Espanyolet, Palma. CEIP Verge del Carme, Maó. CEIP Vialfàs, Sa Pobla. CEIP Voramar, Can Picafort, Santa Margalida. CP Ciutat de Màlaga.

Instituts d’educació secundària

IES Balàfia, Sant Joan de Labritja.  IES Berenguer d’Anoia, Inca.  IES Francesc de Borja Moll, Palma. IES Guillem Colom Casasnovas, Sóller. IES Guillem Sagrera, Palma. IES Joan Alcover, Palma. IES Joan Ramis i Ramis, Maó. IES Josep Maria Llompart, Palma. IES Llucmajor. IES Manacor. IES Na Camel·la, Manacor. IES Pau Casasnovas, Inca. IES Politècnic, Palma. IES Son Pacs, Palma.

Centres concertats

Col·legi Beat Ramon Llull, Inca. Col·legi Manjon, Palma. CIDE, Palma. La Salle, Inca. Sant Vicenç de Paül, Esporles. Santo Tomás de Aquino, Inca.

Centres d’Educació de Persones Adultes

CEPA Francesc de Borja Moll.

Camps d'Aprenentatge 

Camp d’Aprenentatge de Son Ferriol. Camp d’Aprenentatge d’Orient.

CEP i CPR

CPR Eivissa. CEP Inca. CEP Palma. EOEP Inca. EOEP Palma

EOEP i Equips d’atenció primerenca

CEE Son Ferriol, Palma. Equip d’atenció primerenca, Manacor.

Altres entitats privades

Llibreria Fundació Movientes, Maó. Fundació Museu Cosme Bauçà, Felanitx. Fundació Natzaret. Societat Arqueològica Luliana. STEI. PSOE, Esporles. FETE, Palma.

Ajuntaments

Ajuntament d’Inca. Ajuntament d’Esporles. Ajuntament de Maria de la Salut. Ajuntament d’Alcúdia.

Entitats públiques

Consell de Mallorca. Departament d’Història de l’Educació de la UIB.
El Museu ha rebut també d’una donació externa per part del CPR i Museu Pedagògic d’Osca.