A les Illes Balears no s’havia realitzat una planificació estratègica, i a curt termini, de polítiques d’R+D+I que quedessin plasmades en un pla formal fins l’elaboració del I Pla de Recerca, Desenvolupament Tecnològic i el I Pla d’innovació (2001-2004). Aquests dos plans varen ser analitzats, avaluats i criticats amb professionalitat i rigor, i es va considerar tractar de forma unitària l’R+D+I, i per tant substituir els dos plans anterior per un sol pla conjunt: el Pla de Ciència, Tecnologia i Innovació de les Illes Balears (2005-2008).

Des de llavors, cada quatre anys el Consell de Govern ha anat aprovant un nou Pla de Ciència, Tecnologia i Innovació, en els quals s’aprofundia en les actuacions que havien estat positives en els Plans anteriors, es posava més recursos, si la situació econòmica ho permetia, en els programes que implicaven interacció i relació entre els elements del sistema d'innovació de les Illes Balears i intentava corregir els errors i les mancances detectades durant els períodes anteriors. Aquests plans han suposat la creació d’una base prou consolidat de les polítiques regionals de ciència i innovació a les Illes Balears.