La Conselleria d’Agricultura i Pesca és l’organisme que gestiona la reserva marina, amb un servei de vigilància, una comissió de seguiment formada pels diferents col·lectius implicats (ajuntaments, confraries de pescadors, pescadors recreatius, entitats conservacionistes, etc.), i un seguiment cientificopesquer finançat actualment amb fons europeus estructurals d’ajudes a la pesca (IFOP). Vigilen la reserva tres persones, amb una embarcació ràpida amb radar, sonda, GPS i visió nocturna. Com a les altres reserves de la comunitat autònoma, la feina d’aquest servei consisteix a registrar la informació diària de les activitats que es duen a terme dins la zona protegida, a informar el públic sobre els objectius i la regulació de la reserva, a controlar que la normativa es compleixi, a coordinar tasques amb els inspectors pesquers del Consell Insular de Menorca i amb la Guàrdia Civil, a controlar la veracitat de les dades dels quaderns de seguiment pesquer dels vaixells professionals, i a elaborar una base de dades que contengui tota aquesta informació, la qual es tramet periòdicament a la Direcció General de Medi rural i Marí. Així mateix, el cos de vigilància participa en el manteniment de la infraestructura de la reserva (balises de senyalització, plafons informatius, embarcacions i equipaments, etc.) i està en contacte permanent amb les confraries de pescadors i amb els membres de la comissió de seguiment de la reserva. D’altra banda, s’han editat tríptics i pòsters divulgatius que expliquen la normativa de la reserva i la importància de conservar-ne les diferents comunitats i espècies marines.